Le Pays Basque n'est pas seulement une destination pour les paysagers qui arrivent par terre et air, mais aussi, de plus en plus, pour ceux qui le font par mer.
Le Port de Bilbao est un destin choisi par de nombreux navires de croisière transitant par le Golfe de Bizkaia. Le terminal de croisières est situé dans la belle ville de Getxo, à côté d'un port de plaisance, une zone de loisirs et une plage distinguée avec le drapeau bleu par l'UE.
Le centre de Bilbao est à seulement 20 minutes par route, il existe un service d'autobus qui relie le terminal á la plage et au Pont Bizkaia (Patrimoine Mondial), et à la ville de Bilbao.
Le terminal de croisières du port héberge une office du tourisme qui offre des informations sur le Pays Basque.
De son côté, le port de Pasaia est une autre destination de l'offre croisière. Se trouve très proche des principaux attraits touristiques de Gipuzkoa et la ville de San Sebastián est à seulement 5 kilomètres. Il existe aussi un service régulier d'autobus et de train (Topo) qui relient le port à San Sebastián.